中国农业科学院郑州果树研究所成立于1960年，50年薪火相传，50年沧桑巨变。在农业部、中国农业科学院及各级的关心重视下，在兄弟单位及各界朋友的支持帮助下，经过历代研究所人的艰苦奋斗和不懈努力，研究所不断发展壮大，目前已发展成为人才力量比较雄厚、专业学科比较齐全、基础设施、综合实力较强的果树瓜类科技创新中心之一。现有在职职工209人，其中，博士、硕士70余人，职称60人；院杰出岗位人才8人,省部级突出贡献专家4人；中国农科院研究生院在我所设有博士、硕士培养点。是中国农科院文明单位和河南省文明单位，有“省会居住环境”、“河南省绿化十佳单位”、“河南省五好基层党组织”等许多殊荣。 研究所设8个专业研究机构，在此基础上，形成了果树瓜类种质资源、果树瓜类遗传育种、果树瓜类栽培生理、果树瓜类贮藏加工和果品质量安全及控制五个学科；“果树种质郑州葡萄、桃资源圃”、“葡萄桃改良中心”、“落叶果树良繁基地”、“西甜瓜中期工作库”、“农业部果品及苗木质量监督检验测试中心”、“农业部瓜果脱毒种苗成果转化基地”、“河南省果树瓜类生物学重点实验室”、“中国农科院果树生长发育与品质控制重点开放实验室”等11个科研及产业平台依托我所建设；中国园艺学会西甜瓜专业委员会、中国园艺学会桃分会、中国园艺学会石榴分会、河南省园艺学会果树专业委员会、河南省农学会葡萄专业委员会等5个学术团体挂靠我所。建立了3个科技型企业，设置了3个管理机构。主办《果树学报》、《中国瓜菜》、《果农之友》和《中外果树栽培技术精选》四份科技期刊。在农业部组织的“十五”全国农业科研机构综合实力评估中，研究所在参评的1077个农业科研机构中总排名第90名。